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Im Rahmen des Forschungsprogramms der KABS e.V. werden neben den Untersuchungen zur Biologie und  zum Vorkommen der Stechmücken im KABS-Gebiet vor allem behördliche Auflagen zur Überprüfung der Umweltverträglichkeit erfüllt. Es ist die Aufgabe der Wissenschaft, Fragen kompetent zu beantworten, die sich im Rahmen der öffentlichen Diskussion  ergeben, z.B. zu den Folgen der biologischen Bekämpfungsmaßnahmen für das   Nahrungsnetz unter besonderer Berücksichtigung der Vögel, Amphibien und

neue Erkenntnisse stärker  vernetzt. Darüber hinaus arbeitet die KABS e.V. eng mit der GFS (Gesellschaft zur Förderung der Stechmückenbekämpfung) e.V. zusammen. Sowohl die KABS als auch die GFS sind gemeinnützige Vereine. Während die Anwendung der biologischen Stechmückenbekämpfung die Aufgabe der KABS e.V. ist, ist die GFS e.V. für die Forschung zuständig, die über den reinen Anwendungsbezug hinausgeht. So werden z.B. mit der Untersuchung des Überträgerpotentials (Vektorkompetenz) einheimischer Stechmückenarten für Krankheitserreger und des Auftretens neuer Stechmückenarten auch Aufgaben im seuchenhygienischen Bereich übernommen. Die Forschungsarbeiten werden  überwiegend in den KABS-eigenen Laboratorien im Rahmen von Diplom- und Doktorarbeiten sowie von den Wissenschaftlern der KABS e.V.in Zusammenarbeit mit den Universitäten vorgenommen. Insgesamt werden jährlich zwischen 5 und 10 % des Budgets der Kabs e.V. in Forschungs- und Kartierungsarbeiten investiert, um die Bekämpfung zu optimieren und deren Erfolg langfristig zu gewährleisten.
Einen  wesentlichen  Beitrag  zur  Umsetzung  wissenschaftlicher  Erkenntnisse  in  eine ökologisch  orientierte,  erfolgreiche  Bekämpfungsstrategie  leistet  der wissenschaftliche Beirat der KABS e.V.. Dieser wird vom Präsidenten einberufen. Ihm gehören neben der KABS-Geschäftsführung und Vertretern  der betroffenen Gemeinden vor allem Wissenschaftler verschiedener Universitäten und Instituten an.
Der Beirat trifft sich mehrmals im Jahr, um aktuelle organisatorische und wissenschaftliche Fragen im Rahmender biologischen Stechmückenbekämpfung zu diskutieren. Die Umsetzung der wissenschaftlichen Erkenntnisse ist vor allem dem Engagement vieler junger Biologen bei der KABS e.V. zu verdanken.